El nombre del club “Guaraní” proviene precisamente de la raza guaraní, del idioma nativo y de los primeros pobladores de la tierra paraguaya. Se cree que fue fundado el 12 de octubre de 1903. Algunos de sus fundadores fueron Manuel Bella, Ramón Caballero y Salvador Melian. A este famoso club se lo conoce también como “El Aborigen (por el indio), El Cacique, El Legendario (antiguo) y Entidad de Dos Bocas”. En cualquier sitio en el que se menciona estos apodos se sabe que se está hablando de aquel club paraguayo, el Guaraní. Este club se inscribió en el año 1906, en la antigua Liga Paraguaya de Football Association, hoy renombrada bajo la denominación de Asociación Paraguaya de Fútbol. Fue así que junto a Olimpia, Nacional, Libertad y Gral. Díaz, fundó la mencionada entidad matriz del balompié paraguayo.
El general Bernardino Caballero, un hombre vinculado estrechamente al fútbol, donó parte de su quinta (actual Parque Caballero) para las primeras canchas de fútbol. El club nació en la residencia del señor Juan Patri Bello, situada en la actual calle Alberdi, haciendo esquina con las de El Paraguayo Independiente y la de Benjamín Constant (actual Correo Nacional). Este fue su primer presidente y el responsable del único gol con el que Guaraní derrotó a Olimpia en aquel primer encuentro futbolístico registrado en el Paraguay.
En octubre de 1921, un incendio que se produjo en el Club Mbiguá, ocasionó la pérdida de documentos irrecuperables acerca de la historia de club, dichos documentos se encontraban en una secretaría del Mbiguá.
En 1984 ganó su noveno campeonato en la primera categoría del balompié paraguayo terminando con la hegemonía impuesta por el Olimpia de seis años consecutivos (1978 a 1983).
De este club surgieron grandes estrellas del fútbol, como Felipe Santiago Ocampos, Luis Ivaldi, Juan Graciano González, Arsenio Valdez, Genaro “el búfalo” García y el portero Raimundo Aguilera, llamado “El arquero de América”, quien más tarde fue transferido al Palmeiras, de Brasil. Hoy por hoy, el club cuenta con jugadores de primer nivel, tanto paraguayos y como algunos extranjeros.
En los años `60, fue el gran dominador del Paraguay y repetido embajador en las Copas Libertadores de aquellos años, ocupando el tercer lugar en 1970.
Guaraní es un clubque participó en la formación y promoción de valores jóvenes, como del fútbol paraguayo Osvaldo Díaz, Pablo Giménez, Julio Manzur y Aureliano Torres, célebres medallistas de los Juegos Olímpicos de Atenas 2004; así como también integrantes de la Selección Sub 20, Sub, 17 y Sub 15.
En 1968, se convirtió en el primer club del Paraguay en realizar una gira por Europa, en las que visitó España y Alemania. El club Guaraní sería uno de los cuatro clubes más populares del Paraguay, y cuenta con aproximadamente 12.000 socios inscriptos, además de un gran número de simpatizantes por todo el país.
Disputa el "clasico mas añejo" con olimpia, por que son los clubes mas viejos del paraguay.
Pero ultimamente,hay una rivalidad muy grande entre Guarani y Libertad, por los que ellos disputan clasico más importante después del Olimpia-Cerro Porteño
En 2010, y tras varios intentos que casi tuvieron éxito en los últimos años, de la mano del entrenador Félix Darío León y bajo la presidencia de Juan Alberto Acosta, el equipo de Guaraní se coronó campeón del fútbol paraguayo luego de 26 años. Algunos de los jugadores más sobresalientes de la campaña fueron Jonathan Fabbro, Rodrigo Teixeira (máximo goleador), Pablo Aurrecochea, Elvis Marecos, César Cáceres Cañete, Eduardo Filippini, Ángel Ortiz, Julián Benítez, Hugo Notario, entre otros.[4]
[editar] La conquista de 1967
La década de los ’60 fue definida como la "época de oro" para el club Guaraní, que conformó un buen plantel, introdujo las primeras normas de profesionalismo al fútbol paraguayo y peleó siempre por los sitios de punta. Tras el título logrado en 1964 se produjo la conquista de 1967, con la misma base.La hinchada
La hinchada aurinegra oficial se fundó el 18 de enero de 1999. Surgió gracias a la iniciativa y la emoción de un grupo de amigos que se reunió en el local del club con la decisión de alentar al Guarani en todos los lugares al que le toque ir a jugar.Entre sus fundadores se encuentran Alvaro Benítez, Carlos Gomez, Robinson “Robin” Fernández, Félix “ceci” Fleitas y Luis Sartorio, entre otros. Se autodenominaron “la raza aurinegra” en honor a la raza paraguaya, la mezcla de originario y español. Su propósito es de apoyar a su club en las buenas y en las malas, llueva o haga calor, para así trasmitir a los jugadores, dirigentes y al público en general la pasión que sienten por los colores.Se lo denomina La Raza Aurinegra,siempre está ubicado en las graderias norte o sur.La hinchada tiene fuertes rivalidades con Cerro Porteño,Olimpia,Libertad,y luque. Algunas ciudades que se destaca son:La Raza Fdo,La Raza Villa Elisa,La Raza Lambaré y La Raza San Lorenzo,etc.
